실시간 중합효소연쇄반응

실시간 중합효소연쇄반응(영어: real-time polymerase chain reaction, real-time PCR, quantitative real time polymerase chain reaction, qPCR)은 분자생물학에서 중합효소 연쇄 반응을 기반으로한 실험방법이다. 실시간 중합효소연쇄반응은 목표 DNA분자의 증폭과 양의 측정을 동시에 한다. DNA샘플에서 하나 또는 그 이상의 특정 서열을 위해, 실시간 중합효소연쇄반응은 검출과 양의 측정을 할 수 있게한다. 계량은 절대적인 복제 수 또는 상대적인 양을 셀 수 있다.

실험의 진행은 일반적인 중합효소연쇄반응을 따른다; 중요한 특징은, 증폭된 DNA가 실시간으로 측정된다는 것이다. 이 점이 마지막에서 DNA가 관측이 되는 기본적인 중합효소연쇄반응과의 차이점이다. 두가지의 일반적인 방법이 실시간 중합효소연쇄반응에서 사용된다. (1) 아무 DNA이중나선에 끼어들어갈 수 있는 불특정한 형광염색, (2) 올리고뉴클레오티드로 이루어진 서열-특이적 DNA탐침, 형광으로 보고자가 라벨되어있고, 상보적인 DNA목표에 결합한 뒤 검출된다.

종종, 실시간 중합효소연쇄반응은 세포 또는 조직의 mRNA와 non-coding RNA를 수량화하기 위해 역전사 중합연쇄반응과 결합되어 행해진다.

실시간 중합효소연쇄반응의 줄인말로 qPCR(quantitative PCR)이란 말도 쓰인다.[1] 실시간 중합효소연쇄반응은 종종 qRT-PCR로 불리기도 한다.[2][3][4] 한편 "RT-PCR"로 일반적으로 불리는 것은 역전사 중합연쇄반응(reverse transcription polymerase chain reaction)을 말하며, 실시간 중합효소연쇄반응(real-time PCR)이 아니다. 그러나 모든 저자들이 이 관습에 집착하지는 않는다.[5]

바이러스 진단키트 RTPCR편집

바이러스 진단키트로는 RT-PCR(실시간 PCR)이 검사결과의 안정성에서 WHO 표준으로 받아들여지고있으며 CDC 표준도 바이러스진단키트로는 RT-PCR이다. 한편 엘라이자 키트(ELISA kit)는 면역항체를 검사하는 방법으로 바이러스진단 결과시간을 비교적 빠르나 검증 측면에서는 2019년 현재 기술방식으로는 아직 안정성이 답보되고있어 WHO 표준으로 받아들여지지못하고있으며 CDC 표준도 아닌것으로 알려져있다.[6] 또한 대한민국의 한 바이러스 진단키트회사는 미국 CDC보다 앞서 KCDC에 코로나19 바이러스를 진단하는 바이알 화학 용액을 포함하는 진단키트를 AI의 도움으로 개발해 승인받은바있다고 미국 CNN이 보도한바있다.[7][8]

각주편집

  1. VanGuilder HD, Vrana KE, Freeman WM (2008). “Twenty-five years of quantitative PCR for gene expression analysis”. 《Biotechniques》 44 (5): 619–626. doi:10.2144/000112776. PMID 18474036. 
  2. Udvardi MK, Czechowski T, Scheible WR (2008). “Eleven Golden Rules of Quantitative RT-PCR”. 《Plant Cell》 20 (7): 1736–1737. doi:10.1105/tpc.108.061143. PMC 2518243. PMID 18664613. 
  3. Spackman E, Suarez DL (2008). “Type A influenza virus detection and quantitation by real-time RT-PCR”. 《Methods Mol Biol》 436: 19–26. doi:10.1007/978-1-59745-279-3_4. PMID 18370037. 
  4. Gertsch J, Güttinger M, Sticher O, Heilmann J. (2002). “Relative quantification of mRNA levels in Jurkat T cells with RT-real time-PCR (RT-rt-PCR): new possibilities for the screening of anti-inflammatory and cytotoxic compounds”. 《Pharm Res》 19 (8): 1236–1243. doi:10.1023/A:1019818814336. PMID 12240952. 
  5. edited by Julie Logan, Kirstin Edwards, and Nick Saunders. (2009). Logan J, Edwards K, Saunders N, 편집. 《Real-Time PCR: Current Technology and Applications》. Caister Academic Press. ISBN 978-1-904455-39-4. 
  6. 정종훈 (2020년 3월 15일). “美 엉뚱한 코로나 진단키트 비판…질본 "한국 공식키트 아니다". 《중앙일보》. 
  7. 정한영 (2020년 3월 13일). “씨젠, 인공지능으로 단 수주만에 '코로나19 진단 키트' 개발... 美 CNN 집중보도”. 《인공지능신문》. [깨진 링크(과거 내용 찾기)]
  8. Ivan Watson, Sophie Jeong, Julia Hollingsworth and Tom Booth (2020년 3월 13일). “How this South Korean company created coronavirus test kits in three weeks”. 《CNN》.