진핵생물

핵막이 있는 생물

진핵생물(眞核生物, 영어: Eukaryota)은 진핵세포를 가진 생물을 말한다. 진핵세포(眞核細胞)는 세포 내에 으로 대표되는 다양한 세포소기관을 가진 세포들을 통칭하는 이름이다. 세포소기관 중 미토콘드리아엽록체는 과거 진화 과정에서 외부의 원핵세포들이 세포내 공생체로 도입된 경우로 생각되며, 그 외의 소기관들도 각각 특정한 업무를 수행하도록 분화되어 있다. 원핵세포DNA와는 달리, 진핵세포의 DNA에는 필요 없는 부분(인트론)이 대단히 많이 존재하며, 따라서 필요한 부분(엑손)을 이어서 mRNA를 만들게 된다. 또한 리보솜은 원핵세포보다 큰 80S이다.

진핵생물
진핵생물의 생물다양성(왼쪽 상단부터 시계방향으로: 가위벌, 그물버섯, 섬모충, 페르시아미나리아재비, 좁쌀공말, 침팬지)
진핵생물의 생물다양성(왼쪽 상단부터 시계방향으로: 가위벌, 그물버섯, 섬모충, 페르시아미나리아재비, 좁쌀공말, 침팬지)
생물 분류ℹ️
역: 진핵생물역(Eukaryota)
(Chatton, 1925) Whittaker & Margulis, 1978
상군[2]
식물계(Plantae)
동물계(Animalia)
균계(Fungi)

진핵생물은 단계통군으로 나타나며, 3개의 생물 중 하나를 구성한다. 나머지 2개의 역은 세균고균으로, 원핵생물로 불리며 이상과 같은 특징을 갖고 있지 않다. 진핵생물은 모든 생명체 중에서는 일종의 소수이다. 심지어 인체에는 사람의 세포 수보다 10배나 많은 미생물이 들어 있다.[3] 그러나 진핵생물은 수가 가장 많다. 3개의 중에 거의 가장 많은 종이 알려져 있다.

도메인 분류 편집

린네 헤켈 채튼 코플랜드 휘태커 워즈 캐빌리어스미스
1735년
2계 분류
1866년
3계 분류
1925년
2계 분류
1938년
4계 분류
1969년
5계 분류
1977년
6계 분류
1990년
3역 분류
1993년
8계 분류
1998년
6계 분류
(다루지 않음) 원생생물
(Protista)
원핵생물
(Prokaryota)
모네라
(Monera)
모네라
(Monera)
진정세균
(Eubacteria)
세균
(Bacteria)
진정세균
(Eubacteria)
세균
(bacteria)
고세균
(Archaeabacteria)
고세균
(Archaea)
고세균
(Archaeabacteria)
진핵생물
(Eukaryota)
원생생물
(Protista)
원생생물
(Protista)
원생생물
(Protista)
진핵생물
(Eukarya)
고동물
(Archezoa)
원생동물
(Protozoa)
원생동물
(Protozoa)
유색조식물
(Chromista)
유색조식물
(Chromista)
식물
(Vegetabilia)
식물
(Plantae)
식물
(Plantae)
식물
(Plantae)
식물
(Plantae)
식물
(Plantae)
식물
(Plantae)
균류
(Fungi)
균류
(Fungi)
균류
(Fungi)
균류
(Fungi)
동물
(Animalia)
동물
(Animalia)
동물
(Animalia)
동물
(Animalia)
동물
(Animalia)
동물
(Animalia)
동물
(Animalia)

계통 분류 편집

다음은 2006년 토머스 캐빌리어스미스가 제안한 생명의 나무 계통 분류이다.[4]

LUA

녹만균문

이상구균-서열균문

남세균문

나선상균문

스핑고박테리아

섬유균문

녹색유황세균문

의간균문

부유균류

프로테오박테리아

열포균문

푸소박테리움균문

네가티비콕쿠스강

후벽균, 몰리쿠테스강

방선균문

네오무라

고세균역

진핵생물역

2014년이 되자 지난 20년간의 계통발생학 연구에서 대략적인 합의가 나타나기 시작했다.[5][6] 대부분의 진핵생물은 아모르페아(단편모생물 가설과 구성이 유사)와 식물과 대부분의 조류 계통을 포함하는 디포다(이전의 쌍편모생물)라는 두 개의 큰 계통군 중 하나에 속할 수 있다. 세 번째 주요 그룹인 엑스카바타측계통군이기 때문에 공식적인 그룹으로 폐기되었다.[7]

다음에 제안된 계통발생에는 엑스카바타 생물군 중 단 하나의 그룹(디스코바)만 포함되어 있으며[8] 피코조아홍조식물의 가까운 친척이라는 2021년 제안이 포함되어 있다.[9] 프로보라는 2022년에 발견된 미생물 포식자 집단이다.[10] 메타모나다는 아마도 디스코바, 아마도 말라이모나스문의 자매일 가능성이 있어 배치하기 어렵다.[5][11][12]

진핵생물
디포다
디아포레틱케스

크립티스타  

원시색소체생물
홍조식물 (홍조류)

 

16억 년 전

로델피스

피코조아

 

회청조식물

 

11억 년 전
녹색식물 (식물)

 

10억 년 전
16억 년 전

합티스타  

TSAR

텔로네마류  

SAR
할바리아

부등편모조류    

피하낭류  

리자리아

 

5억 5천만 년 전

프로보라  

헤미마스티고포라류  

디스코바  

? 메타모나다  

쌍편모생물

안키로모나스류  

말라이모나스류  

CRuMs

 

아모르페아
아메바류

 

오바조아

브레비아타류  

아푸소모나스목  

후편모생물
홀로미코타 (균류 포함)

 

홀로조아 (동물 포함)

 

11억 년 전
13억 년 전
15억 년 전
22억 년 전?

각주 편집

  1. Sakaguchi M, Takishita K, Matsumoto T, Hashimoto T, Inagaki Y (July 2009). “Tracing back EFL gene evolution in the cryptomonads-haptophytes assemblage: separate origins of EFL genes in haptophytes, photosynthetic cryptomonads, and goniomonads”. 《Gene》 441 (1–2): 126–31. doi:10.1016/j.gene.2008.05.010. PMID 18585873. 
  2. Adl, Sina M.; 외. (September 2012). “The revised classification of eukaryotes” (PDF). 《Journal of Eukaryotic Microbiology》 59 (5): 429–514. doi:10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x. PMC 3483872. PMID 23020233. 2016년 6월 16일에 원본 문서 (PDF)에서 보존된 문서. 
  3. Zimmer, Carl (2010년 7월 13일). “How Microbes Defend and Define Us”. 《뉴욕타임스(New York Times)》. 2011년 4월 9일에 확인함. 
  4. Cavalier-Smith T (2006). “Cell evolution and Earth history: stasis and revolution”. 《Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci》 361 (1470): 969–1006. doi:10.1098/rstb.2006.1842. PMC 1578732. PMID 16754610. 
  5. Burki F (2014년 5월). “전 지구적인 계통발생학적 관점에서 본 진핵생물의 생명나무”. 《Cold Spring Harbor Perspectives in Biology》 6 (5): a016147. doi:10.1101/cshperspect.a016147. PMC 3996474. PMID 24789819. 
  6. Burki F; Kaplan M; Tikhonenkov DV; Zlatogursky V; Minh BQ; Radaykina LV; Smirnov A; Mylnikov AP; Keeling PJ (2016년 1월). “Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista”. 《Proceedings: Biological Sciences》 283 (1823): 20152802. doi:10.1098/rspb.2015.2802. PMC 4795036. PMID 26817772. 
  7. Adl SM; Bass D; Lane CE; Lukeš J; Schoch CL; Smirnov A; Agatha S; Berney C; Brown MW; Burki F; Cárdenas P; Čepička I; Chistyakova L; Del Campo J; Dunthorn M; Edvardsen B; Eglit Y; Guillou L; Hampl V; Heiss AA; Hoppenrath M; James TY; Karnkowska A; Karpov S; Kim E; Kolisko M; Kudryavtsev A; Lahr DJ; Lara E; Le Gall L; Lynn DH; Mann DG; Massana R; Mitchell EA; Morrow C; Park JS; Pawlowski JW; Powell MJ; Richter DJ; Rueckert S; Shadwick L; Shimano S; Spiegel FW; Torruella G; Youssef N; Zlatogursky V; Zhang Q (2019년 1월). “Revisions to the Classification, Nomenclature, and Diversity of Eukaryotes”. 《The Journal of Eukaryotic Microbiology》 66 (1): 4–119. doi:10.1111/jeu.12691. PMC 6492006. PMID 30257078. 
  8. Brown, Matthew W.; Heiss, Aaron A.; Kamikawa, Ryoma; Inagaki, Yuji; Yabuki, Akinori; Tice, Alexander K; Shiratori, Takashi; Ishida, Ken-Ichiro; Hashimoto, Tetsuo; Simpson, Alastair; Roger, Andrew (2018년 1월 19일). “Phylogenomics Places Orphan Protistan Lineages in a Novel Eukaryotic Super-Group”. 《Genome Biology and Evolution》 10 (2): 427–433. doi:10.1093/gbe/evy014. PMC 5793813. PMID 29360967. 
  9. Schön ME; Zlatogursky VV; Singh RP; 외. (2021). “Picozoa are archaeplastids without plastid”. 《Nature Communications》 12 (1): 6651. doi:10.1038/s41467-021-26918-0. PMC 8599508. PMID 34789758. 
  10. Tikhonenkov DV; Mikhailov KV; Gawryluk RM; Belyaev AO; Mathur V; Karpov SA; Zagumyonnyi DG; Borodina AS; Prokina KI; Mylnikov AP; Aleoshin VV; Keeling PJ (2022년 12월). “Microbial predators form a new supergroup of eukaryotes”. 《네이쳐》 612 (7941): 714–719. Bibcode:2022Natur.612..714T. doi:10.1038/s41586-022-05511-5. PMID 36477531. S2CID 254436650. 
  11. Burki, Fabien; Kaplan, Maia; Tikhonenkov, Denis V.; Zlatogursky, Vasily; Minh, Bui Quang; Radaykina, Liudmila V.; Smirnov, Alexey; Mylnikov, Alexander P.; Keeling, Patrick J. (2016년 1월 27일). “Untangling the early diversification of eukaryotes: a phylogenomic study of the evolutionary origins of Centrohelida, Haptophyta and Cryptista”. 《Proc. R. Soc. B》 283 (1823): 20152802. doi:10.1098/rspb.2015.2802. PMC 4795036. PMID 26817772. 
  12. Karnkowska, Anna; Vacek, Vojtěch; Zubáčová, Zuzana; Treitli, Sebastian C.; Petrželková, Romana; Eme, Laura; Novák, Lukáš; Žárský, Vojtěch; Barlow, Lael D. (2016). “A Eukaryote without a Mitochondrial Organelle”. 《Current Biology》 26 (10): 1274–1284. doi:10.1016/j.cub.2016.03.053.