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* [[박테리오파지 λ]]
* [[박테리오파지 T4]]
* [[박테리오파지 Φ X 174]] - 최초로 [[게놈]]이 완전히 분석된 바이러스이다. 이것의 게놈은 5386개의 염기쌍으로 구성된 11개의 [[유전자]]가 하나의 원을 이루는 구조로 되어있다.
* [[담배 모자이크 바이러스]]
<br clear="all"/>
모델 생물로 쓰이는 [[원핵생물]]:
 
* '''[[대장균]]''' - 대장균은 대표적인 [[그램 음성균]]으로 [[분자생물학]] 연구에 널리 쓰인다.
* '''[[고초균]]''' - 고초균은 [[내생포자]]를 갖는 대표적인 [[그람염색|그람 양성균]]이다.
* '''[[카울로박터 크레센투스]]''' - 이 박테리아는 뚜렷이 다른 두 종류로 분화되어 [[세포 분화]]연구의 주요 모델 생물로 이용된다.
* '''[[미코플라스마 게니탈리움]]''' - 가장 작은 생물로 알려져 있다.
* '''[[비프리오 피세리]]''' - 발광성 미생물이다.
* '''[[남세균]]'''- [[광합성]]을 하여 산소를 만드는 세균이다.
* '''[[슈도모나스 플루오레슨스]]''', 실험실에서 서로 다른 두 종류로 분화되는 세균이다.
 
모델 생물로 쓰이는 [[원생생물]]:
* '''[[클라미도모나스 레인하드티]]''' - [[엽록소]]를 이용한 [[광합성]]과 [[편모]]를 이용한 [[운동성]]을 둘 다 가지고 있는 [[녹조류]]<ref>[http://genome.jgi-psf.org/chlamy Chlamydomonas reinhardtii resources at the Joint Genome Institute]</ref>
* '''[[딕티오스텔리움 디스코이데움]]''' - [[분자생물학]]과 [[유전학]]에서 [[세포 신호]], [[세포 분화]] 등을 연구하는데 이용되는 점균. 이에 대한 연구 결과는 [http://dictybase.org 딕티베이스] 에 정리되어 있다.<ref>데이비드 슬론 윌슨, 김영희 역, 진화론의 유혹, 북스토리, 2009, ISBN 89-93480-16-8, 204쪽</ref>
* '''[[테트로히메나 테르모피아]]''' - 깨끗한 물에 사는 [[섬모충류]]의 일종
* '''[[에밀리아니아 훅슬레이]]''' - [[해양]] [[백화 현상]]을 일으키는 부유 석회 편모류.<ref>한국해양연구소 해양물리연구단 안유환, [http://ocrl.kordi.re.kr/directory/paper/white-4.html 동해의 "白花현상" 원인에 대한 고찰]</ref>
모델 생물로 쓰이는 [[식물]]:
<gallery>
파일:Arabidopsis thaliana.jpg|[[애기장대]]
파일:Spirodela polyrrhiza 00.jpg|[[개구리밥]]
파일:Maispflanze.jpg | [[옥수수]]
</gallery>
* [http://www.biologie.uni-muenchen.de/ou/cellbio/forschung.php Ludwig-Maximillians-Universität Department Biologie II]
* [http://fishwiki.igib.res.in/TWiki_4_2_4/bin/view/Main/WebHome Zebrafish GenomeWiki Community Annotation Project ] mainteined by the Institute of Genomics and Integrative Biology
* [http://www.emutagen.com/wrkhzoo.html Workhorse Zoo by Adam Zaretsky]
* Mandoli DF, Olmstead R (2000): ''[http://www.springerlink.com/content/hx8h7hdhmjppbd63/fulltext.pdf The importance of emerging model systems in plant biology].'' Journal of plant growth regulation 19 (3): 249-252
* {{cite journal저널 인용|author=Tuskan GA, Difazio S, Jansson S, ''et al.'' |title=The genome of black cottonwood, Populus trichocarpa (Torr. & Gray) |journal=Science |volume=313 |issue=5793 |pages=1596–604 |year=2006 |month=Sep |pmid=16973872 |doi=10.1126/science.1128691 }}
* {{cite journal저널 인용|author= Sequencing Project, International Rice Genome|title=The map-based sequence of the rice genome |journal=Nature |volume=436 |issue=7052 |pages=793–800 |year=2005 |month=Aug |pmid=16100779 |doi=10.1038/nature03895 }}
* [http://miracle.igib.res.in/cgi-bin/fishmap/gbrowse/ FishMap: The Zebrafish Community Genomics Browser] maintained at the Institute of Genomics and Integrative Biology
 

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