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본초강목을 편찬하기 위하여 이시진은 약 27년의 세월을 걸쳐 작성하였으며, 세 번 다시 수정하였고, 800여 종의 문헌을 참고했다. 또한 현지 조사와 표본 채집 등도 병행하는 등 자신의 심혈을 기울인 역작이다.
총 52권을 수록하였고, 약의 종류는 1892종 (374종은 새로 받아들인 것), 1109장의 도해와 11,096종의 처방이 들어 있으며, 이 중 8,000여개는 이시진 자신이 수집·확정하였다. 약마다 이름을 주해하였으며, 명칭을 고증하고, 산지를 수록하고,
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