그는 본처 강리성(1879년 출생)과 1899년 결혼하여 4남을 잃고 슬하에 1911년 차영애와영애와 1918년 차영희영희 두딸을 얻은 이후, 부인 강리성은 일제의 핍박을 피해 1920년대에 중국 상해로 두딸과 함께 가서 동암 차이석을 내조하시다가 1937년내조하다가 중일전쟁이 발발함에 따라 가족 중 강리성과 둘째딸 차영희는 평양으로 돌아와 일제 감시하에 해방 때 까지 모진 고초를 당하였다.당하였고, 첫째딸 차영애는 부친 차이석과 함께 중국에 남았다남아 독립운동을 하였다. 본처인 강리성여사는 해방 후 서울 마포구 동교동에서 둘째딸 차영희의 가족과 함께 생활하시다가 1961년 사망 후 효창원 애국선열묘역에 자리한 차이석묘소에 합장되었다. 중국에서 본부인과 떨어져 지내던 차이석은 31세 과부인 홍매영과의 사이에서 1944년 서자 아들인 영조를 낳았다, 이때 차이석의 나이 63세였다.
