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글루카곤은 일반적으로 [[포도당신생합성]]과 [[글리코겐 분해]]를 촉진하여 [[혈액|혈중]] [[포도당]]의 농도를 증가시킨다.
 
포도당은 [[다당류]]인 [[글리코겐]] 형태로 간에 저장되어 있다. [[간세포]]는 [[글루카곤 수용체]]를 가지고 있다. 글루카곤이 수용체에 결합하면 간세포는 글리코겐을 포도당 분자로 분해하여 혈류로 내보낸다(글리코겐 분해). 저장된 글리코겐이 고갈되면 글루카곤은 간과 신장으로 하여금 포도당을 새로 합성하게 한다. 글루카곤은 간에서 일어나는 [[해당과정|해당]]을 차단하고 해당 과정의 중간체들이 포도당신생합성에 참여하도록 한다.
 
글루카곤은 또한 [[지방 분해]]를 통한 포도당 생성 속도를 조절한다. 제1형 당뇨병 같은 인슐린 억제 상태에서 글루카곤은 지방 분해를 유도한다.<ref>{{저널 인용|언어=en | author = LILJENQUIST, JOHN E. et al | title=Effects of Glucagon on Lipolysis and Ketogenesis in Normal and Diabetic Men |journal=J Clin Invest.|date=1974-01|url=http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC301453/pdf/jcinvest00157-0198.pdf |pmc=301453 |pmid=4808635 |doi=10.1172/JCI107537 |volume=53 |issue=1 |pages=190–7}}</ref>
아데닐산 고리화효소는 [[고리형 아데노신 일인산]](cAMP)을 생산하고, cAMP는 [[단백질 인산화효소 A]](cAMP 의존성 단백질 인산화효소)를 활성화한다. 단백질 인산화효소 A는 [[가인산분해효소]] [[키나제|인산화효소]]를, 가인산분해효소 인산화효소는 [[글리코겐 가인산분해효소]]를 활성화하여 가인산분해효소 A라는 활성형으로 전환한다. 가인산분해효소 A는 글리코겐 중합체에서 포도당-1-인산을 방출하는 역할을 한다.
 
[[해당과정|해당]]과 [[포도당신생합성]]의 협동적인 조절 관계는 과당-2,6-이인산<ref name="Claus, TH et al_1984">{{저널 인용|언어=en | author = Claus TH, El-Maghrabi MR, Regen DM, Stewart HB, McGrane M, Kountz PD, Nyfeler F, Pilkis J, Pilkis SJ | title = The role of fructose 2,6-bisphosphate in the regulation of carbohydrate metabolism | journal = Curr. Top. Cell. Regul. | volume = 23 | issue = | pages = 57–86 | year = 1984 | pmid = 6327193 | doi = }}</ref><ref group="주">해당의 일차적인 조절 단계 효소인 인산과당인산화효소-1을 활성화한다. 즉 해당 과정을 촉진한다.</ref> 을 생성하는 효소의 상태에 맞추어 조절된다.<ref name="Hue L & Rider MH_1987">{{저널 인용|언어=en | author = Hue L, Rider MH | title = Role of fructose 2,6-bisphosphate in the control of glycolysis in mammalian tissues | journal = Biochem. J. | volume = 245 | issue = 2 | pages = 313–24 | year = 1987 | pmid = 2822019 | pmc = 1148124 | doi = }}</ref> 글루카곤이 개시한 연쇄반응에 의해 활성화된 단백질 인산화효소 A는 과당-2,6-이인산을 분해하는 기능(과당-2,6-이인산분해효소, FBPase-2)과 생성하는 기능(인산과당인산화효소-2, PFK-2)을 모두 갖는 단백질의 [[세린]] 잔기를 인산화한다.<ref name="nelson587">{{서적 인용
|author=DAVID L. NELSON
|editor=백형환, 윤경식, 김호식 외 역

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