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* 2015년: [[아사히상]]<ref>[http://www.asahi.com/shimbun/award/asahi/2014prizewinner.html {{lang|ja|朝日賞 2014(平成26)年度 受賞者一覧}}] - 아사히 신문사</ref>
* 2015년: [[노벨 생리학·의학상]]<ref>[http://mainichi.jp/feature/news/20151006k0000m040011000c.html {{lang|ja|ノーベル賞：医学生理学賞に大村智氏ら3人}}] {{웨이백|url=http://mainichi.jp/feature/news/20151006k0000m040011000c.html |date=20151006162443 }} - 마이니치 신문, 2015년 10월 5일</ref>
* 2016년: 바이오인더스트리 협회 특별명예상<ref>[http://www.jba.or.jp/pc/activitie/research_encouragement/info/002054.html {{lang|ja|大村 智 氏にバイオインダストリー協会特別名誉賞を贈呈}}] {{
=== 상훈·영예 ===
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