|
!구단!!연고지!!홈구장!!수용인원!!감독!!비고
|-
|'''[[기라반츠 기타큐슈]]'''||[[후쿠오카현]], [[기타큐슈 시기타큐슈시]]||[[기타큐슈 시립 혼조 육상 경기장|혼조 스타디움]]||align=right|10,202||{{국기그림|일본}} [[하라다 다케오]]||bgcolor=#FFDAB9|[[J2리그 2016]] 22위
|-
|'''[[도치기 SC]]'''||[[도치기현]], [[우쓰노미야 시우쓰노미야시]]||[[도치기 그린 스타디움]]||align=right|18,025||{{국기그림|일본}} [[요코야마 유지]]||[[J3리그 2016]] 2위
|-
|'''[[AC 나가노 파르세이루|나가노 파르세이루]]'''||[[나가노현]], [[나가노 시나가노시]]||[[미나미 나가노 스포츠 파크]]||align=right|15,000||{{국기그림|일본}} [[미우라 후미타케]]||[[J3리그 2016]] 3위
|-
|[[블라우블리츠 아키타]]||[[아키타현]], [[아키타 시아키타시]]||[[아키타 시립 야바세 축구 경기장|아키긴 스타디움]]||align=right|4,992||{{국기그림|일본}} [[스기야마 고이치 (축구인)|스기야마 고이치]]||[[J3리그 2016]] 4위
|-
|[[가고시마 유나이티드 FC|가고시마 유나이티드]]||[[가고시마현]], [[가고시마 시가고시마시]]||[[가고시마 가모이케 스타디움]]||align=right|19,934||{{국기그림|일본}} [[아사노 데츠야]]||[[J3리그 2016]] 5위
|-
|'''[[카탈레 도야마]]'''||[[도야마현]], [[도야마 시도야마시]]||[[도야마 종합 운동 공원 육상 경기장]]||align=right|28,494||{{국기그림|일본}} [[미우라 야스토시]]||[[J3리그 2016]] 6위
|-
|[[후지에다 MYFC]]||[[시즈오카현]], [[후지에다 시후지에다시]]||[[후지에다 종합운동장]]||align=right|13,000||{{국기그림|일본}} [[오이시 아츠토]]||[[J3리그 2016]] 7위
|-
|[[FC 류큐]]||[[오키나와현]]||[[오키나와 종합 운동 공원 육상 경기장]]||align=right|25,000||{{국기그림|조선민주주의인민공화국}} [[김종성 (1964년)|김종성]]||[[J3리그 2016]] 8위
|-
|[[SC 사가미하라]]||[[가나가와현]], [[사가미하라 시사가미하라시]]||[[사가미하라 아사미조 공원 경기장]]||align=right|15,000||{{국기그림|일본}} [[사쓰카와 노리히로]]||[[J3리그 2016]] 11위
|-
|[[그루자 모리오카]]||[[이와테현]], [[모리오카 시모리오카시]]||[[사우스 파크 축구 경기장]]||align=right|5,000||{{국기그림|일본}} [[아키히코 가미카와]]||[[J3리그 2016]] 13위
|-
|[[후쿠시마 유나이티드 FC|후쿠시마 유나이티드]]||[[후쿠시마현]], [[후쿠시마 시후쿠시마시]]||[[후쿠시마 아즈마 경기장]]||align=right|21,000||{{국기그림|일본}} [[구리하라 게이스케]]||[[J3리그 2016]] 14위
|-
|[[가이나레 돗토리]]||[[돗토리현]]||[[돗토리 시영 축구장]]||align=right|16,033||{{국기그림|일본}} [[하시라타니 데쓰지]]||[[J3리그 2016]] 15위
|-
|[[요코하마 스포츠 앤 컬처 클럽|YSCC 요코하마]]||[[가나가와현]], [[요코하마 시요코하마시]]||[[닛파쓰 미쓰자와 스타디움]]||align=right|15,454||{{국기그림|일본}} [[히구치 야스히로]]||[[J3리그 2016]] 16위
|-
|[[아술 클라로 누마즈]]||[[시즈오카현]], [[누마즈 시누마즈시]]||[[시즈오카 아시타카 육상 경기장]]||align=right|10,000||{{국기그림|일본}} [[요시다 켄]]||bgcolor=#ADD826|[[일본 축구 리그 2016|JFL 2016]] 3위
|-
|}
| 