유희왕 5D's: 두 판 사이의 차이

유우기와유우기(유희)와 쥬다이의 시대로부터 수십 년 후. 도미노 시티는 '네오 도미노 시티'라 불리며, 상류 계층이 사는 '시티'와 빈민가를 연상시키는 하층민들의 거주지 '새틀라이트'로 나뉘어 있었다. 새틀라이트에 살고 있는 주인공 '후도 유세이(유성)'는 자신과 동료들을 배신하고 시티로 떠나 킹이 된 '잭 아틀라스'를 만나기 위해 시티로의 잠입을 시도하고 그곳에서 만난 잭과 듀얼하게 된다. 잭의 에이스 카드 '레드 데몬즈 드래곤'과 유세이의 에이스 카드 '스타 더스트 드래곤'이 부딪치는 순간 잭과 유세이의 팔에서 붉은 반점이 나타나고, 듀얼을 하던 경기장에서는 붉은 용이 나타나 어쩔 수 없이 듀얼을 중지하게 된다. 그리고 찾아온 시큐리티에게 유세이는 새틀라이트 인의 몸으로 시티에 출입한 죄를 물어 잡혀가게 된다.

포츈 컵 이후 새로운 킹으로 추대받았음에도 조용히 살고 있던 유세이. 그러던 어느 날, 정체를 알 수 없는 수상한 사람을 뒤쫓았다가 그 사람과 듀얼을 하면서 '다크 싱크로'라는 이상한 것을 목격하게 된다. 이후 페루의 나스카 문명이 갑자기 사라지는 기이한 현상이 발생하게 되고, 네 명의 시그너(유세이, 잭, 루카, 아키)는 각각 자신을 '다크 시그너'라고 칭하는 이들을 만나게 된다.

유세이는 과거의 동료인 '키류 쿄스케'를, 잭은 자신이 해야할 것을 깨닫게 해 준 여기자 '칼리 나기사'를, 루카는 자신의 에이스 카드인 '에인션트 페어리 드래곤'을 가지고 있는 '디마크'를, 그리고 아키는 자신 때문에 남동생이 죽었다는 '미스티'를 크로우 는 자신의처지와자신의 처지와 같은 같은보머를보머를 각각 만나 듀얼할 수 밖에 없는 상황에서 일행은 이미 정해진 '다크 시그너'와의 대결을 맞이하는데...