유전자 온톨로지

유전자 온톨로지(영어: gene ontology, GO)는 모든 생물 종에 걸쳐 유전자 및 유전자 산물 속성의 표현을 통합하기 위한 주요 생물정보학 이니셔티브이다.^[1] 이 프로젝트의 보다 구체적인 목표는 다음과 같다. 1) 유전자 및 유전자 산물 속성에 대한 통제 어휘를 유지하고 발전시킨다. 2) 유전자 및 유전자 산물에 주석을 달고, 주석 데이터를 통합하고 전파한다. 3) 프로젝트에서 제공하는 데이터의 모든 측면을 쉽게 접근할 수 있는 도구를 제공한다. 예를 들어 충분한 분석을 통해 유전자 온톨로지를 사용하여 실험 데이터의 기능적 해석을 가능하게 한다.^[2]^[3] GO는 OBO 파운드리의 초기 후보 멤버 중 하나인 Open Biomedical Ontologies의 더 큰 분류 노력의 일부이다.^[4]

같이 보기 편집

각주 편집

↑ The Gene Ontology Consortium (January 2008). “The Gene Ontology project in 2008”. 《Nucleic Acids Research》 36 (Database issue): D440–4. doi:10.1093/nar/gkm883. PMC 2238979. PMID 17984083.
↑ Dessimoz, Christophe; Škunca, Nives, 편집. (2017). 《The Gene Ontology Handbook》. Methods in Molecular Biology 1446. doi:10.1007/978-1-4939-3743-1. ISBN 9781493937431. ISSN 1064-3745.
↑ Gaudet, Pascale; Škunca, Nives; Hu, James C.; Dessimoz, Christophe (2017). 〈Primer on the Gene Ontology〉. 《The Gene Ontology Handbook》. Methods in Molecular Biology 1446. 25–37쪽. doi:10.1007/978-1-4939-3743-1_3. ISBN 978-1-4939-3741-7. ISSN 1064-3745. PMC 6377150. PMID 27812933.
↑ Smith B, Ashburner M, Rosse C, Bard J, Bug W, Ceusters W, Goldberg LJ, Eilbeck K, Ireland A, Mungall CJ, Leontis N, Rocca-Serra P, Ruttenberg A, Sansone SA, Scheuermann RH, Shah N, Whetzel PL, Lewis S (November 2007). “The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration”. 《Nature Biotechnology》 25 (11): 1251–5. doi:10.1038/nbt1346. PMC 2814061. PMID 17989687.

외부 링크 편집

위키데이터에 관련 속성이 있습니다.

유전자 온톨로지 ID (P686)
(사용 현황)

AmiGO - the current official web-based set of tools for searching and browsing the Gene Ontology database
Gene Ontology Consortium - official site
PlantRegMap - GO annotation for 165 plant species and GO enrichment Analysis
SimCT — web-based tool to display relationships between biological objects annotated to an ontology, in the form of a clustering tree.
SerbGO — a GO tool to compare the capabilities of different programs to show their common features and their differences and to find which tools, if any, have some specific user-required capabilities for GO analysis.
Domain-centric Gene Ontology — database of domain-centric ontologies on functions, phenotypes, diseases and more.

[pmid17984083-1] The Gene Ontology Consortium (January 2008). “The Gene Ontology project in 2008”. 《Nucleic Acids Research》 36 (Database issue): D440–4. doi:10.1093/nar/gkm883. PMC 2238979. PMID 17984083.

[GO-2] Dessimoz, Christophe; Škunca, Nives, 편집. (2017). 《The Gene Ontology Handbook》. Methods in Molecular Biology 1446. doi:10.1007/978-1-4939-3743-1. ISBN 9781493937431. ISSN 1064-3745.

[GaudetŠkunca2017-3] Gaudet, Pascale; Škunca, Nives; Hu, James C.; Dessimoz, Christophe (2017). 〈Primer on the Gene Ontology〉. 《The Gene Ontology Handbook》. Methods in Molecular Biology 1446. 25–37쪽. doi:10.1007/978-1-4939-3743-1_3. ISBN 978-1-4939-3741-7. ISSN 1064-3745. PMC 6377150. PMID 27812933.

[pmid17989687-4] Smith B, Ashburner M, Rosse C, Bard J, Bug W, Ceusters W, Goldberg LJ, Eilbeck K, Ireland A, Mungall CJ, Leontis N, Rocca-Serra P, Ruttenberg A, Sansone SA, Scheuermann RH, Shah N, Whetzel PL, Lewis S (November 2007). “The OBO Foundry: coordinated evolution of ontologies to support biomedical data integration”. 《Nature Biotechnology》 25 (11): 1251–5. doi:10.1038/nbt1346. PMC 2814061. PMID 17989687.

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