SYBR 그린 I
SYBR 그린 I (사이버 그린 I, SYBR Green I, SG)은 분자 생물학에서 핵산을 착색시키는데 사용되는 비대칭 사이아닌(cyanine)[1] 염색약이다. SYBR 염색약 종류는 분자 프로브 사(社)(Molecular Probes, inc.)에서 생산되며, 이 회사는 라이프 테크놀로지 사(Life Technologies Corporation)의 자(子)회사이다. DNA-염색약의 복합체 결과물은 청색광(λmax = 497 nm)을 흡수하며 녹색광(λmax = 520 nm)을 방출한다. 염색약은 우선적으로 이중 가닥 DNA에 결합하지만, 낮은 정도로 단일 가닥 DNA도 염색한다. SYBR 그린은 DNA에서 보다 낮은 정도로 RNA 또한 염색 할 수 있다.
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| 이름 | |
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| IUPAC 이름
N',N'-dimethyl-N-[4-[(E)-(3-methyl-1,3-benzothiazol-2-ylidene)methyl]-1-phenylquinolin-1-ium-2-yl]-N-propylpropane-1,3-diamine
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| 식별자 | |
3D 모델 (JSmol)
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| ChEMBL | |
PubChem CID
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CompTox Dashboard (EPA)
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| 성질 | |
| C32H37N4S+ | |
| 몰 질량 | 509.73 g/mol |
| 용해도 | Normally supplied solvated in dimethylsulfoxide |
달리 명시된 경우를 제외하면, 표준상태(25 °C [77 °F], 100 kPa)에서 물질의 정보가 제공됨.
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사용 편집
SYBR 그린은 생화학과 분자 생물학의 영역에서 사용된다. 이는 정량적 PCR[2]의 몇가지 방법에서 이중 가닥 DNA의 정량화를 위한 염색약으로 사용된다. 이는 또한 겔 전기영동에서 DNA를 시각화하기 위해 사용된다. 고 농도의 SYBR 그린은 아가로스 겔에서 DNA 존재를 시각화하기 위해 사용될 수 있다. 순수핵산의 라벨링(labeling)뿐만 아니라 SYBR 그린은 유동세포계수법(flow cytometry)과 형광 현미경을 위해 세포안의 DNA을 라벨링 하는데 에도 사용될 수 있다.
안전성 편집
SYBR 그린 I은 강력한 인간 돌연변이 유발원인 브롬화에티듐(Ethidium bromide, EtBr) 을 대체하기 위해 상품화되었다. 이는 작업하기에도 안전하며 에티듐 폐기물 문제로부터도 자유롭다. 하지만 높은 친화도로 DNA와 결합이 가능한 작은 분자는 어떤 것이든 발암 물질일 수 있으며, 이는 SYBR Green 도 포함된다.
화학물질이 돌연변이를 일으키는 능력을 측정하는 에임스 검사법(Ames test)을 실시한 연구[3]에서, 같은 농도로 분석했을 때, 브롬화에티듐과 SYBR 그린의 상대적인 돌연변이 유발성에 있어 분명한 패턴이 있지는 않았다. 고농도에서는 브롬화에티듐이 더욱 돌연변이 발생률이 높았다.
유사 시아닌 염료 편집
- SYBR Green II
- SYBR Gold
- YO (Oxazole Yellow)
- TO (Thiazole Orange)
- PG (PicoGreen)
참고 편집
- ↑ Zipper H; Brunner H; Bernhagen J; Vitzthum F (2004). “Investigations on DNA intercalation and surface binding by SYBR Green I, its structure determination and methodological implications”. 《Nucleic Acids Research》 32 (12): e103. doi:10.1093/nar/gnh101. PMC 484200. PMID 15249599.
- ↑ Mackay IM; Arden KE; Nitsche A (March 2002). “Real-time PCR in virology”. 《Nucleic Acids Res.》 30 (6): 1292–305. doi:10.1093/nar/30.6.1292. PMC 101343. PMID 11884626.
- ↑ Singer VL; Lawlor TE; Yue S (February 1999). “Comparison of SYBR Green I nucleic acid gel stain mutagenicity and ethidium bromide mutagenicity in the Salmonella/mammalian microsome reverse mutation assay (Ames test)”. 《Mutation research》 439 (1): 37–47. doi:10.1016/s1383-5718(98)00172-7. PMID 10029672.