일반적인 퀴즈쇼와 달리, 제퍼디의 퀴즈방식은 설명문에 알맞는 키워드를 질문문으로 답해야 하는 것이다. 각 라운드마다 6개의 주제에 총 30개의 설명문이 출제된다. 예를 들어, "인물의 200달러 문제"에서 "이 사람은 미합중국의 초대 대통령입니다."라는 설명문이 나왔다고 치자. 버저를 빨리 누른 도전자에게 답할 기회가 주어지며, 도전자는 "조지 워싱턴이 누구죠?"라고 답해야 200달러를 적립할 수 있다. 버저를 누른 뒤 5초 안에 답해야 하며 틀리면 적립금에서 문제의 금액만큼 깎인다.
설명문 중에는 하루에 하나씩 데일리 더블(Daily Double) 문제가 나오는데, 지금까지의 적립금을 두배로 만들 수 있다.
1회전 제퍼디! 라운드
1964–1975
1978–1979
1984–2001
2001–현재
1990 초대
$10
$25
$100
$200
200
$20
$50
$200
$400
400
$30
$75
$300
$600
600
$40
$100
$400
$800
800
$50
$125
$500
$1,000
1,000
2회전 더블 제퍼디! 라운드
1964–1975
1978–1979
1984–2001
2001–현재
1990 초대
$20
$50
$200
$400
500
$40
$100
$400
$800
1,000
$60
$150
$600
$1,200
1,500
$80
$200
$800
$1,600
2,000
$100
$250
$1,000
$2,000
2,500
파이널 제퍼디! 라운드
하나의 주제에 대한 설명문이 출제된다. 3명의 도전자들은 제한시간 30초 안에 1, 2회전에서 적립한 금액 중 원하는 금액만큼 걸고 답을 적는다. 역시 답은 질문문으로 적어야 한다. 정답을 맞추면 건 금액만큼 더 적립되며, 틀리면 건 금액만큼 적립금이 깎인다.
정답에 자신있는 도전자는 비교적 금액을 많이 거는 편이며, 세 도전자가 얼마나 금액을 거느냐에 따라 역전승도 가능하다.
적립금이 가장 많은 도전자는 굳이 돈을 걸어서 위험을 감수하지 않으려는 경향이 있으며, 반대로 적립금이 적은 도전자는 모두 걸어 역전을 노리기도 하지만 답을 틀려 적립금을 모두 잃는 경우가 허다하다. 이 프로그램의 이름을 제퍼디!(위험해!)로 지은 이유가 바로 여기에 있다.
만약 모든 도전자가 적립금을 모두 잃을 경우, 다음 회차에서는 리터닝 챔피언 없이 새로운 도전자 3명이 출전하게 된다.
최종 적립금이 많은 도전자가 이날의 우승자가 되며 적립금은 상금으로 모두 챙겨가게 된다. 또한 다음 방송에서 연승에 도전할 수 있는 리터닝 챔피언이 된다. 2등은 2000달러, 3등은 1000달러의 상금을 받는다.
리터닝 챔피언(연승도전자)
그 전에는 5연승까지 도전할 수 있었으며, 시즌 20부터는 무제한 연승 제도로 바뀌었다.
만약 질병이나 업무의 사정으로 인해 연속 출전이 어려울 경우, 추후에 공동 챔피언으로 다시 출전할 수 있다.
최다연승기록은 2004년 6~11월, 74연승을 기록한 현 진행자 켄 제닝스이며, 총 획득상금은 $2,522,700 (한화 약 30억원)였다.