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* '''유임스 본드''' : 38회 서울의료원 편에서 몰래 나머지 멤버를 아웃시키는 미션을 하여 [[제임스 본드]]에서 딴 별명이다. 91회에서 물총 1주년 기념으로 나머지 멤버들을 재수감시키는 특별사면 미션을 한 바도 있다. 최근에는 2대 본드를 뽑는 특집도 진행되었다. (그러나 후계자 후보 이광수의 최종미션 중 실수로 후계자는 뽑히지 못했다.)
* '''메뚜기''' : 얼굴이 메뚜기랑 많이 닮아서 붙여진 별명.
* 노의 달인 : 유재석이[[유재석]]이 [[무한도전]] 조정특집에 이어 제주도 특집에서도 노젓기를 하여 붙은 별명이다.
* 피터 재석 : 60회 디큐브 백화점 편에서 하하가[[하하]]가 유재석에게[[유재석]]에게 초록색 정장을 선물하여 입어서 붙은 별명이다.
* 국민메뚜기 : 77회 빙고레이스 중 유재석이[[유재석]]이 지진희를[[지진희]]를 노린 도발로 소녀시대의 'Gee'를 불렀는데 이때 지석진이[[지석진]]이 지진희에게[[지진희]]에게 유재석을[[유재석]]을 향해 "야, 이 메뚜기야" 라고 한 마디 하라고 하자 그때 지진희가[[지진희]]가 유재석에게[[유재석]]에게 "국민메뚜기에게 어떻게 메뚜기라고 하나" 라고 하는 장면에서 생긴 별명이다. 파란팀이 이를 보고 국민메뚜기를 줄여서 '국메' 라고 불렀다.
* 유명수 : 88회에서 [[하지원]]과 팀 결정 게임을 하던 중 하하가[[하하]]가 유재석의[[유재석]]의 안경을 벗겼는데, 그 모습이 [[박명수]]와 닮아서 붙었다.
* 미소의천사 : 유재석이[[유재석]]이 예능 프로그램에 잘웃는다고 하여 붙어진 별명 그레서 런닝맨 인기 별명인 1인자가 탄생되었다.
* 만년 유망주 : 142회에서 유재석이[[유재석]]이 같은 팀인 김종국과[[김종국]]과 이보영에게[[이보영]]에게 너무나 혹독한 코치를 받아 그 괴로움을 호소할 때 자막으로 뜸.
* 메미넴: 13년도 크리스마스의 악몽 편에서 미션 힌트를 얻기 위해 유재석이[[유재석]]이 지석진과[[지석진]]과 함께 다이나믹 듀오에게 렙을 선보이면서 붙여진 별명이다. 미국의 렙퍼 에미넴의[[에미넴]]의 이름을 따고 유재석의[[유재석]]의 별명인 메뚜기를 합쳐서 만들어졌다. 이밖에도 구관조/앵무새 랩을 선보이기도 했다.
* '''딱지왕''' : 유재석이[[유재석]]이 딱지를 잘 쳐서 붙여진 별명. 그러나 이 별명은 [[김종국]], [[지석진]] 순으로 계속 이동되었다.
* 유MC(일명 깐족 MC): 아이돌 체육대회 편에서 일일 MC를 맡아서 붙은 별명. MC를 맡는 동안 수차례 깐족대어서 깐족 MC라고도 한다. 이후 퀴즈 특집에서도 일일 MC를 맡았다.
* 유셜록: 14년도 밀실아웃사건 편에서 범인([[김종국]])에 대한 힌트를 찾는 중에 탐정 흉내를 내서 붙여진 별명
* 예능 깡패 : 2015년 첫 방송에서 유재석이[[유재석]]이 유난히 다혈질이어서 붙여진 별명
* '''1인자''' : 유재석이[[유재석]]이 런닝맨 내에서는 리더로 통하고 인기도 많아서 1인자라는 것이다.다른 멤버들(특히 [[김종국]],[[지석진]],[[이광수]] 등)이 호시탐탐 1인자 자리를 노리는 경우도 많다. 이 별명은 다른 방송에서도 많이 쓰인다.
* 재순: 여장 했을때 붙여진 별명
* 사막의 여우 : 유재석이[[유재석]]이 사막에서 생활하는 법을 잘 아는 듯 보여서 붙여진 별명이다.
* '''요다''' : 유재석이[[유재석]]이 요다를 닮아서 붙여진 별명이다.
* 바둑의신 : 전에 32회에서 바둑알 바둑판을 준비한곳에서 유재석이[[유재석]]이 멤버들을 다꺾어다 하지만 김종국과[[김종국]]과 마지막 바둑게임에서 진순간 운 좋게 남았있던 칸을 닌자처럼 바둑판을 빨리 했어 붙은 별명이다
==== [[지석진]] ====
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