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과거 반란군 출신들과 지지자들 사이의 권력기반을 넓히기 위해 쿠바 정부는 권력을 잡자마자 혁명 시민군을 조직했다.
[[1959년 2월]] 피델 카스트로는 쿠바의 총리가 되었다. 그는 즉시 국가 경제의 개혁에 착수하여, 임대와 전기 요금을 내리고 집권 첫 해인 1959년 5월, 토지개혁법으로 거의 보상 없이 사유 토지 및 재산을 몰수하였고, 400 헥타르 이상의 토지와 공공 시설을 유상 몰수하여 국유화하였으며, 민영 부문에 대한 통제를 강화하는 한편, 도박 산업을 금지시켰다. 또한 정부는 쿠바에서 많은 미국 시민권자들을 축출하였다. <ref> {{뉴스 인용 |제목 = CIA conspired with mafia to kill Castro |url = http://www.guardian.co.uk/world/2007/jun/27/usa.cuba |확인날짜=2009-04-05 }}</ref> <ref>{{웹 인용 | url=http://www.carpenoctem.tv/mafia/lansky.html | 제목=Meyer Lansky | 확인날짜=2009-04-06 | 보존url=https://web.archive.org/web/20050403170341/http://www.carpenoctem.tv/mafia/lansky.html | 보존날짜=2005-04-03 | 깨진링크=예 }}</ref> 쿠바 변호사 마리오 라소는 크기에 관계없이 농장들을 정부가 점유했다고 썼다. 쿠바의 중상류층이 소유하던 토지, 기업, 회사도, 피델 카스트로 가족이 소유한 농장도 국유화되었다. 이러한 조치들은 피델 카스트로 정부에 의하여 시에라 마에스트라 선언에서 기초한 프로그램이라는 명분으로 착수되었다. <ref>{{웹 인용 |url=http://www.chibas.org/raul_chibas_manifiesto.php |제목=Familia Chibás > Raul Antonio Chibás > Manifiesto Sierra Maestra |확인날짜=2009-04-06 |언어=스페인어 |보존url=https://web.archive.org/web/20130117013342/http://www.chibas.org/raul_chibas_manifiesto.php |보존날짜=2013-01-17 |깨진링크=예 }}</ref> 쿠바의 중산층은 카스트로가 정권을 잡자마자 대부분 쿠바를 탈출하였다. 이들 망명자의 대부분은 바로 물 건너 미국의 마이애미에 정착하여 격렬한 반 카스트로 운동을 벌이며 미국의 대외 정책에 커다란 영향력을 행사하고 있다.
초기에는 토지개혁 등 민주주의혁명의 성격을 띠었으나, 1960년 후반 이후부터는 공산주의혁명으로 이행하기 시작하였다. 미국 소유의 원유, 전화, 전기 회사와 설탕 공장의 국유화에 따라 미국의 이익이 직접적으로 영향을 받으면서 미국과의 관계도 악화되었다. 대신에 미국은 쿠바의 설탕 수입을 줄였고 소련은 쿠바의 설탕 잉여분을 사들였으며 무역과 기술 대표단을 파견하였다. 1960년 말까지 혁명 정부는 총 250억 미국 달러에 달하는 사유 재산을 국유화하였다. <ref name="Lazo">Lazo, Mario, ''American Policy Failures in Cuba--Dagger in the Heart!'' 1970 Twin Circle Publishing Co., New York, pp.198-200, 240</ref> 이중 미국인의 재산은 불과 1억 미국 달러를 상회했을 뿐이다. <ref name="Lazo"/> <ref> Faria, Miguel A. ''Cuba in Revolution--Escape from a Lost Paradise'', 2002, Hacienda Publishing, Macon, Georgia, pp.105,182,248</ref> 또한 1960년 8월 6일에 미국과 다른 외국 소유의 재산도 모두 국유화되었다. 이에 미국은 미국 내 쿠바인의 자산을 동결하고 쿠바에 대한 통상 제한을 강화하는 것으로 대응해서 지금까지 거의 50년간 지속되고 있다.
1960년 말까지, 정권에 반대하는 모든 신문사들이 폐쇄되었고 모든 라디오, 텔레비전 방송국은 정부의 통제에 놓이게 되었다. [[마이애미]]로 망명한 쿠바 반체제 인사들의 주장에 따르면 <ref name="Lewis">{{서적 인용 |제목 = Authoritarian regimes in Latin America |저자 = Paul H. Lewis}} </ref> 온건주의자, 교사, 교수들은 숙청되으며 <ref name="Lewis"/> 어떤 한 해에는 약 2만여명의 반대파들이 비인간적인 투옥 조건에서 구속되고 고문을 당하였다고 한다.<ref name="Lewis"/> 동성연애자들은 1960년대에 포로수용소에 감금되었고, 거기서 그들은 의학적, 정치적으로 "재교육"을 받아야 했는 주장도 제기되었다. <ref name="Hirschfeld-since1898">{{서적 인용 |제목 =Health, politics, and revolution in Cuba since 1898 |저자 = Katherine Hirschfeld}}</ref> 어떤 추정에 따르면 이때 1만5천~1만7천명이 처형되었다. <ref>Black Book of Communism. p. 664.</ref> 카스트로가 최고지도자인 공산당은 1당 체제를 강화하였다. <ref name="Lewis"/> 피델의 동생 라울 카스트로는 육군참모총장이 되었다. <ref name="Lewis"/> 반제제 인사들에 따르면 쿠바에서는 카스트로에 대한 충성이 모든 관직에 대한 주요한 판단기준이 되었다. <ref name="Staten-Cuba">{{서적 인용 | 제목 = The history of Cuba |저자 = Clifford L. Staten}}</ref> 그들은 또한 1960년 9월, 혁명 정부가 혁명보위위원회(Committees for the Defense of the Revolution, CDR)라는 이웃 감시 시스템을 만들었다고 주장했다. <ref name="Lewis"/> 사람들 사이에 정부의 밀고자가 판쳤다고 한다. 지역 혁명 보위 위원회에서는 주민들이 서로 소비 습관, 외국인 접촉 정도, 직업과 교육 이력, 그밖에 "수상한" 행동을 감시하는 세부 기록을 관리했다고 한다. 그러나 이같은 주장들의 사실 여부는 확인되지 않았으며 쿠바 정부는 이 주장들을 부정하고 있다.<ref>{{서적 인용 |제목 = Fidel Castro - my life |저자 = Ignacio Ramonet, Fidel Castro}}</ref>
1961년 새해 퍼레이드에서, 공산당 행정부는 소비에트 연방의 탱크 등 무기를 선보였다. <ref name="Staten-Cuba"/> 마침내, 이 작은 섬나라는 라틴 아메리카에서, 브라질에 이어 2번째의 군사 강국이 되었다. <ref name="cubamilitary">{{웹 인용 | url = http://www.disam.dsca.mil/pubs/Vol%205-2/Cuban.pdf |제목 = Cuban armed forces and the Soviet military presence}}</ref> 쿠바는 소련이 특권을 부여한 우방국이 되었다. <ref name="gonzalez-mccarthy">{{웹 인용 |url=http://www.rand.org/pubs/monographs/2004/RAND_MG111.pdf |제목=Cuba After Castro: Legacies, Challenges, and Impediments|저자=Edward Gonzalez, Kevin F. McCarthy|날짜=2004}}</ref>
[[도적에 대항하는 전쟁]]으로 알려진 반란이 일어나 1965년까지 이어지기도 했다.
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