Pfam: 두 판 사이의 차이
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Pfam은 A와 B의 두개 클래스를 제공하는데 A는 사람이 직접 들여다 보고 만들고 B는 기계를 이용 자동으로 만들고 있다. 이들 각각을 Pfam-A와 Pfam-B라 칭한다.
2006년 4월 6일을 기점으로 하여 현재 7973개의 protein family들이 Pfam-A에 분류되어있다.
== 목적 및 활용방법 ==
기능을 모르는 단백질 서열이 있을 때 그것과 관계가 있다고 생각되는 서열을 찾는 것은 생명과학 분야에서 중요한 첫 걸음이다. 이를 위하여 여러방법들이 존재하는데 대표적으로 FASTA, BLAST, 그리고 Pfam방법이 있다.
이 세가지 방법들은 모두 서열정보만을 이용하여 검색을 한다는 것이 구조정보를 이용한 분류인 SCOP,CATH등과 다른 점이라 할 수 있겠다.
== 한계점 ==
그러나 이들 서열정보를 이용하는 경우는 서열의 유사도 (sequence homology)가 낮지만 기능이나 구조는 유사할 다른 단백질 서열들을 찾는데 한계가 있다. 이들을 위해 remote homology search 하는 방법들이 활발히 연구되고 있다.
== 외부링크 ==
{{bio-stub}}
[[분류:생물정보학]]
[[en:Pfam]]
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