Pfam: 두 판 사이의 차이
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'''Pfam'''은 [[Hidden Markov model]]을 이용하여 단백질의 family들의 [[다중서열정렬]]
Pfam은 A와 B의 두개 클래스를 제공하는데 A는 사람이 직접 들여다 보고 만들고 B는 기계를 이용 자동으로 만들고 있다. 이들 각각을 Pfam-A와 Pfam-B라 칭한다.
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그러나 이들 서열정보를 이용하는 경우는 서열의 유사도 (sequence homology)가 낮지만 기능이나 구조는 유사할 다른 단백질 서열들을 찾는데 한계가 있다. 이들을 위해 remote homology search 하는 방법들이 활발히 연구되고 있다.
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* [http://www.sanger.ac.uk/Software/Pfam/ Pfam 홈페이지]
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