에스토니아 소비에트 사회주의 공화국의 국기는 1953년 2월 6일에 제정되어 1990년 5월 8일까지 사용되었다.
빨간색 바탕 왼쪽 상단에는 노란색 별과 낫과 망치가 그려져 있으며, 국기 아래쪽에는 하얀색, 파란색, 빨간색 세 가지 색의 물결무늬가 그려져 있다.
1940년부터 1953년까지는 빨간색 바탕에 깃대 쪽으로 노란색 별과 낫과 망치 그리고 라틴 문자 "ENSV"가 쓰인 형태의 국기를 사용했다.